那么上述规定中的“造成重大损失”和“造成特别严重后果”具体指什么呢？《关于办理侵犯知识产权刑事案件具体应用法律若干问题的解释》规定，给商业秘密的权利人造成损失数额在50万元以上的，属于给权利人造成重大损失，应当以侵犯商业秘密罪判处3年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；给商业秘密的权利人造成损失数额在250万元以上的，属于造成特别严重后果，应当以侵犯商业秘密罪判处3年以上7年以下有期徒刑，并处罚金。如果企业经过计算发现自己的损失少于规定的金额，达不到刑事立案的要求，可以向工商部门进行举报，通过行政手段保护自己。
实际上，商业秘密一旦被泄露，权利人的损失往往无法弥补。但是为了追究侵权人的刑事责任，受害人必须能够证明自己的损失。在刑事案件中法院一般认为这种损失应当是受害人的实际损失，包括直接损失以及必然失去的现实利益，法官会考虑商业秘密的开发投入、商业秘密的成熟程度、商业秘密的利用周期及其是否可以重复利用，以及商业秘密的使用和转让、市场的供求状况等因素。司法实践中，如果商业秘密权利人的损失难以计算，法院通常以侵权人所获得的利润作为裁判的依据。如果是非法将商业秘密出卖给他人的，以其非法出卖收入为依据，如果是非法使用商业秘密进行生产经营活动的，以其因此获得的利润为依据，但是获利是实际获利，而不包括预期获利。