《窦娥冤》写的是一个孝顺的媳妇窦娥与婆婆相依为命、遭人陷害、蒙冤被斩的故事。《窦娥冤》完成之后，关汉卿就与珠帘秀回到大都，进行公演。公演当天，勾栏院里来了一个威武的汉子，看着看着，他忽然大声哭了起来，边哭边嚷道：“窦娥，你死得冤。我，我一定给你报仇！”众人闻之愕然。汉子见大家都一齐看着自己，也觉失态，便抹了一把眼泪，悻悻地走了。大家只觉得这人有趣，也没当回事。
没想到第二天，平章政事阿合马——也就是害死赵小兰的凶手便在太子府门前被杀。众人在拍手称快的同时也不免纳闷，谁这样大胆，竟敢在太子府前杀人，而且杀的又是这样一个忽必烈眼前的红人呢？
忽必烈听说阿合马被人杀死，大怒，立刻派太子真金亲自办理此案。官府怀疑此案与关汉卿有关，便派人查抄了玉京书会，抓走了关汉卿和珠帘秀，对二人进行严刑拷打。但二人始终咬紧牙关，不说一句话。最后，狱卒竟弄瞎了珠帘秀的一只眼睛，但仍是什么也没问出来。
不久，曾在勾栏院看《窦娥冤》并大哭的汉子投案自首，承认阿合马是他杀的，但却没说是什么原因，便被处斩了。
官府找不到关汉卿与此案有关的证据，只好放他与珠帘秀出狱。但二人从此都再也不能演戏了，便隐居乡下，过起了田园生活。