获得军方高层的同意后，塞耶成为美国派往欧洲考察军事的两名成员之一。在巴黎，他花了近两年的时间，对拿破仑的军事指挥艺术、法国梅兹军校的教学方法，以及富歇的经销训练方式，做了深入的研究。学成归来后，32岁的他被任命为西点军校的校长。
1817年，踌躇满志的塞耶走马上任，并准备在西点军校的教学实践中，实现他的理想。
然而，当他走进西点军校时，眼前的情景使他大吃一惊：陈旧的营房空空荡荡，只有贫穷潦倒的人才会像军校学员一样睡在粗糙的松木地板上，学员餐厅由于条件太差，学员甚至被允许在附近与人搭伙。而学校的教学人员更是缺乏，所学的课本粗浅简单，值班军官很少，更没有像样的等级制度和管理制度，学员管理极不规范，每年4月到11月开课，整个冬季放假。
塞耶一上任，就开始大刀阔斧地对军校进行改革，受限制带四年制教育计划，扩建了图书馆。尤其注重人的培养，在学员中创建“荣誉制度”，在学校学员与学生间倡导公平竞争、共同协作的精神；而且不讲情面，果断开除了违反军校纪律的学员，哪怕是美国政界或军界要员的亲属、子弟也毫不留情。